Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cspp1B2RX88 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cspp1B2RX88 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cspp1B2RX88 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms