Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usf3B2RUQ2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usf3B2RUQ2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usf3B2RUQ2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms