Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Prrt4B2RU40 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms