Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Brpf3B2KF05 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Brpf3B2KF05 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms