Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CK137956B1AYM9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CK137956B1AYM9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms