Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nfx1B1AY10 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nfx1B1AY10 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nfx1B1AY10 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nfx1B1AY10 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms