Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Scml2B1AVB3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Scml2B1AVB3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms