Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm438B1ASB3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm438B1ASB3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms