Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prr29B1ARI9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Prr29B1ARI9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Prr29B1ARI9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms