Protein–RNA interactions for Protein: A2RSL7

4931406B18Rik, RIKEN cDNA 4931406B18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406B18RikA2RSL7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4931406B18RikA2RSL7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4931406B18RikA2RSL7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4931406B18RikA2RSL7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms