Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2al1jA2BFR3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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H2al1jA2BFR3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2al1jA2BFR3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms