Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pramef17A2ASJ1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pramef17A2ASJ1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pramef17A2ASJ1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms