Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
FocadA2AKG8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FocadA2AKG8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FocadA2AKG8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms