Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pramel3A2AHA7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms