Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700023F06RikA2AB62 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
1700023F06RikA2AB62 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms