Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PtprfA2A8L5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprfA2A8L5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms