Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pabpc1lA2A5N3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pabpc1lA2A5N3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpc1lA2A5N3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpc1lA2A5N3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpc1lA2A5N3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpc1lA2A5N3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpc1lA2A5N3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpc1lA2A5N3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc1lA2A5N3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc1lA2A5N3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc1lA2A5N3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc1lA2A5N3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc1lA2A5N3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc1lA2A5N3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc1lA2A5N3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc1lA2A5N3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc1lA2A5N3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc1lA2A5N3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc1lA2A5N3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc1lA2A5N3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc1lA2A5N3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc1lA2A5N3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc1lA2A5N3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc1lA2A5N3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc1lA2A5N3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc1lA2A5N3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc1lA2A5N3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc1lA2A5N3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc1lA2A5N3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc1lA2A5N3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc1lA2A5N3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc1lA2A5N3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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