Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkd2l1A2A259 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pkd2l1A2A259 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2l1A2A259 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2l1A2A259 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2l1A2A259 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2l1A2A259 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2l1A2A259 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2l1A2A259 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pkd2l1A2A259 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pkd2l1A2A259 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkd2l1A2A259 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkd2l1A2A259 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkd2l1A2A259 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkd2l1A2A259 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkd2l1A2A259 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkd2l1A2A259 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkd2l1A2A259 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkd2l1A2A259 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkd2l1A2A259 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkd2l1A2A259 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkd2l1A2A259 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkd2l1A2A259 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pkd2l1A2A259 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms