Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms