Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIF8

Irgm2, Immunity-related GTPase family M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irgm2A0A140LIF8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irgm2A0A140LIF8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irgm2A0A140LIF8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irgm2A0A140LIF8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irgm2A0A140LIF8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irgm2A0A140LIF8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irgm2A0A140LIF8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irgm2A0A140LIF8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irgm2A0A140LIF8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irgm2A0A140LIF8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irgm2A0A140LIF8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Irgm2A0A140LIF8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irgm2A0A140LIF8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Irgm2A0A140LIF8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irgm2A0A140LIF8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irgm2A0A140LIF8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irgm2A0A140LIF8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irgm2A0A140LIF8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irgm2A0A140LIF8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Irgm2A0A140LIF8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irgm2A0A140LIF8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irgm2A0A140LIF8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irgm2A0A140LIF8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irgm2A0A140LIF8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Irgm2A0A140LIF8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irgm2A0A140LIF8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Irgm2A0A140LIF8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irgm2A0A140LIF8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irgm2A0A140LIF8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irgm2A0A140LIF8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irgm2A0A140LIF8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irgm2A0A140LIF8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irgm2A0A140LIF8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irgm2A0A140LIF8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irgm2A0A140LIF8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irgm2A0A140LIF8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms