Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
A0A0U1RNP2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0U1RNP2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms