Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SUK1

AW822073, Expressed sequence AW822073, mousemouse

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AW822073A0A0N4SUK1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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AW822073A0A0N4SUK1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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AW822073A0A0N4SUK1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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AW822073A0A0N4SUK1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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AW822073A0A0N4SUK1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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AW822073A0A0N4SUK1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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AW822073A0A0N4SUK1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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AW822073A0A0N4SUK1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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AW822073A0A0N4SUK1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AW822073A0A0N4SUK1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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AW822073A0A0N4SUK1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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AW822073A0A0N4SUK1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AW822073A0A0N4SUK1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms