Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Trbv26A0A0B4J1P5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Trbv26A0A0B4J1P5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Trbv26A0A0B4J1P5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Trbv26A0A0B4J1P5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Trbv26A0A0B4J1P5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Trbv26A0A0B4J1P5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trbv26A0A0B4J1P5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Trbv26A0A0B4J1P5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Trbv26A0A0B4J1P5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Trbv26A0A0B4J1P5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trbv26A0A0B4J1P5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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