Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trbv21A0A0A6YX06 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trbv21A0A0A6YX06 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trbv21A0A0A6YX06 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trbv21A0A0A6YX06 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trbv21A0A0A6YX06 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trbv21A0A0A6YX06 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trbv21A0A0A6YX06 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Trbv21A0A0A6YX06 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trbv21A0A0A6YX06 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Trbv21A0A0A6YX06 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Trbv21A0A0A6YX06 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Trbv21A0A0A6YX06 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Trbv21A0A0A6YX06 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trbv21A0A0A6YX06 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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