Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Top3bQ9Z321 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top3bQ9Z321 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms