Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Krt27Q9Z320 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Krt27Q9Z320 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms