Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J6

Ptgdr2, Prostaglandin D2 receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgdr2Q9Z2J6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ptgdr2Q9Z2J6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ptgdr2Q9Z2J6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms