Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D6

Mecp2, Methyl-CpG-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mecp2Q9Z2D6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Mecp2Q9Z2D6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mecp2Q9Z2D6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms