Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
Ap3b1Q9Z1T1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ap3b1Q9Z1T1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms