Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sfrp4Q9Z1N6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sfrp4Q9Z1N6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms