Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nek4Q9Z1J2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nek4Q9Z1J2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms