Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NfkbiaQ9Z1E3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms