Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cpne6Q9Z140 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cpne6Q9Z140 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms