Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z101

Pard6a, Partitioning defective 6 homolog alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6aQ9Z101 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pard6aQ9Z101 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pard6aQ9Z101 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pard6aQ9Z101 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pard6aQ9Z101 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pard6aQ9Z101 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pard6aQ9Z101 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pard6aQ9Z101 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms