Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Skp2Q9Z0Z3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Skp2Q9Z0Z3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms