Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dctn3Q9Z0Y1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dctn3Q9Z0Y1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms