Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NgfrQ9Z0W1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NgfrQ9Z0W1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms