Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfn1Q9Z0I7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Slfn1Q9Z0I7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slfn1Q9Z0I7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms