Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
AireQ9Z0E3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
AireQ9Z0E3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
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