Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E2

Chrd, Chordin, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrdQ9Z0E2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ChrdQ9Z0E2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChrdQ9Z0E2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChrdQ9Z0E2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChrdQ9Z0E2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChrdQ9Z0E2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChrdQ9Z0E2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChrdQ9Z0E2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ChrdQ9Z0E2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChrdQ9Z0E2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChrdQ9Z0E2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChrdQ9Z0E2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChrdQ9Z0E2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ChrdQ9Z0E2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ChrdQ9Z0E2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ChrdQ9Z0E2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChrdQ9Z0E2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ChrdQ9Z0E2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChrdQ9Z0E2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChrdQ9Z0E2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChrdQ9Z0E2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChrdQ9Z0E2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ChrdQ9Z0E2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChrdQ9Z0E2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChrdQ9Z0E2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ChrdQ9Z0E2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChrdQ9Z0E2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChrdQ9Z0E2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChrdQ9Z0E2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChrdQ9Z0E2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChrdQ9Z0E2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChrdQ9Z0E2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChrdQ9Z0E2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChrdQ9Z0E2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChrdQ9Z0E2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ChrdQ9Z0E2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChrdQ9Z0E2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ChrdQ9Z0E2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 969.7 ms