Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Apobec2Q9WV35 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apobec2Q9WV35 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms