Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ArcQ9WV31 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ArcQ9WV31 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ArcQ9WV31 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ArcQ9WV31 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ArcQ9WV31 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ArcQ9WV31 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ArcQ9WV31 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ArcQ9WV31 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ArcQ9WV31 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ArcQ9WV31 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ArcQ9WV31 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ArcQ9WV31 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ArcQ9WV31 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ArcQ9WV31 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ArcQ9WV31 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ArcQ9WV31 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms