Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3bgrQ9WUZ7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bgrQ9WUZ7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms