Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnip1Q9WUU8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnip1Q9WUU8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnip1Q9WUU8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms