Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Opn3Q9WUK7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn3Q9WUK7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms