Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUI0

Mixl1, Homeobox protein MIXL1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mixl1Q9WUI0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mixl1Q9WUI0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mixl1Q9WUI0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms