Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lhx9Q9WUH2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lhx9Q9WUH2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms