Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Stub1Q9WUD1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms