Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pdcd6ipQ9WU78 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdcd6ipQ9WU78 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdcd6ipQ9WU78 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms