Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tnfsf13bQ9WU72 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tnfsf13bQ9WU72 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms